특수교육연구소는 특수교육을 전문적으로 지원하기 위하여 특수교육 영역의 정책, 각 장애영역별 교육과정 개발, 교육 프로그램 및 교육자료 개발, 특수교육 관련 전문가들의 학제 간 연구 도모 사업 등을 추진하고 있다. 특수교육관련 연구 활동의 활성화를 도모하고, 보다 독립적인 연구 기능을 수행하고자 한다. ‘특수교육연구소’는 특수교육 관련 학문 분야 간의 다학문적인 연구 및 실천을 위한 기관으로서 자리매김을 목적으로 한다.