본 연구센터는 통일단계 및 통일이후 남북한 교육통합과 학교통합 과정에서 야기될 수 있는 다양한 문제들과 효과적인 통일교육 방안에 대한 연구를 실시하고자 2014년 5월에 설립되었다. 통일한국 사회에 적용할 수 있는 학교교육, 교사교육, 평생교육, 사회통합교육 등 교육 전반에 걸쳐서 실증적 연구를 진행할 뿐만 아니라 이를 바탕으로 통일교육정책을 개발하고 있다. 통일교육연구센터의 구체적인 설립 목적은 다음과 같다: 통일한국을 위한 교육통합 방안 연구, 통일한국의 미래형 통일학교 운영 및 연구, 통일교육정책 개발 및 연구, 통일교육 프로그램 개발 및 연구, 통일한국 교육과정 및 교과서 개발 및 연구